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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
春运首日广九客运段志愿者送“福”进车厢******
(新春走基层) 春运首日广九客运段志愿者送“福”进车厢
中新网广州1月7日电 (郭军 黄伟伟 刘丽娟)“大爷，您慢点，我来帮您推车。”“老奶奶，您行李重，我帮您拿。”1月7日，广州南站站台人头攒动，又是一年春运时，广铁集团广九客运段早已经蓄势待发，为回家过年的旅客们提供引导咨询、提摆行李、扶老携幼、防疫宣传等暖心服务，为春运期间旅客运输畅通保驾护航。
据悉，春运首日，广九客运段组织100余名党团员志愿者在广州南、广州东、深圳北、东莞东、潮汕等车站，以及所值乘的列车上开展春运志愿者服务。
春运首日广九客运段志愿者送“福”进车厢 刘丽娟 摄“大娘，春节就快到了，给您送福啦！”志愿者唐浩然正拿着自己书写的书法，免费送给返乡回家过年的旅客们。
志愿者唐浩然，一名来自东北的小伙子，同时也是一名业余书法爱好者，他说：“希望发挥所长，为回家过年的乡亲们，送上真挚的祝福，祝愿天南地北的旅客们，新的一年事事顺心，福星高照！”
春运首日广九客运段志愿者送“福”进车厢 刘丽娟 摄上午10点30分左右，广九客运段值乘G6104次列车上，开展了“送福进车厢，温暖回家路”主题活动，志愿者们将写好的“福”字送给车厢的旅客，同时也把自己美好的祝福送给了旅客。此外，志愿者们还与旅客贴福字、窗花，挂中国结，把车厢装扮得喜气洋洋，以实际行动共同迎接2023年兔年的到来。
“我经常坐高铁往返老家和广州之间，乘务员的热心服务给我留下深刻的印象，今天一上车就收到志愿者递来的‘福’字感觉特别开心，回到家后我一定要把它贴在门上，沾沾这份喜气。”乘坐该车次回湖南过年的王先生高兴的说道。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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